A história da Misericórdia de Alcáçovas ainda é desconhecida pelo que
apenas se conhecem aspetos pontuais, por vezes carecendo de
confirmação, sobre a sua origem e evolução.
De acordo com lápide em mármore existente na igreja da Misericórdia
esta construção data de 1551. O ano está acompanhado pela inscrição do
dia 10 de Setembro, mas não é claro se com essa data se pretendia
marcar o início ou o fim da obra. Todavia, supõe-se que a fundação da
instituição seja anterior.
Túlio Espanca cita uma escritura, de 13 de Junho de 1551, de doação,
por Margarida Rodrigues, de umas casas para a Misericórdia, situadas
na rua Direita. Mas o texto do documento, até hoje, é desconhecido.
Além disso, nas palavras de Túlio Espanca não é claro se o objetivo da
doação das casas era que estas servissem como sede para fundação da
instituição ou para a construção da igreja nesse espaço.
Daquilo que é possível conhecer, por agora, da história da instituição
através do contacto com a documentação que restou no arquivo da
entidade, sabemos que possuiu um hospital e uma farmácia, tal como
outras suas congéneres, e que ao longo de séculos cumpriu as várias
obras de misericórdia no apoio aos pobres, aos doentes, aos presos e
aos órfãos.